Herramientas digitales académicas

Intento de una awesome list, pero para antropólogos y científicos sociales

Esta lista está inspirada en las listas Awesome. Casi todo lo que recomiendo aquí lo utilizo, lo probé personalmente (aunque sea un poco) o me lo recomendaron mucho. El software es en su mayoría FOSS o que por lo menos tiene una versión gratuita que vale la pena.

Software para análisis cualitativo

• QualCoder - Software de análisis y codificación escrito en Python con soporte para texto, imágenes, audio y video. Libre, abierto y gratuito.
• QCoder - Paquete para la codificación de datos en R. Libre, abierto y gratuito.
• Taguette - Software para codificación de datos de texto. Abierto y gratuito con aplicación Web y de escritorio.

Gestores de bibliotecas personales

• Zotero - Gestor de referencias libre, abierto y gratuito.
  • Better BibTex for Zotero - Integración de BibLaTex para Zotero.
  • ZotFile for Zotero - Gestión de archivos PDF para Zotero.
  • Plugins desarrollados por la comunidad.
  • Zotero hacks - Pequeños trucos para usar Zotero.
• JabRef - Gestor de referencias bibliográficas de código abierto.
• Mendeley - Gestor bibliográfico y red social académica de Elsevier.
• Calibre - Un administrador de libros electrónicos.

Programas para tomar notas

• Joplin - Software libre, de código abierto para tomar notas y tareas pendientes en Markdown para escritorio y celular.
• Notion - Aplicación todo-en-uno para tomar notas, planear proyectos, crear tableros, calendarios, recordatorios y manejar información.
• Simplenote - Aplicación de notas minimalista multiplataforma, con respaldo en la nube, sincronización automática, soporte Markdown y sostenido por el quipo de WordPress y Tumblr.
• Notable - Aplicación de notas en Markdown basado en VS Code.
• WorkFlowy - Una aplicación web para la toma de notas en outlines al estilo fractal.
• RemNote - Notas jerárquicas y aprendizaje con repaso espaciado.
• Boostnote -Espacio de trabajo colaborativo Markdown con herramientas para programadores.
• Ghostwriter - Editor Markdown limpio y sin distracciones para Linux y Windows.

Editores de texto para escribir (y otras cosas)

• Atom - Un gran editor de texto extensible para programar, escribir, seguir tus proyectos en GitHub y mucho más.
  • Atom para el flujo de trabajo académico - Presentación de Juan Carlos Castillo para iniciados en Atom.
  • Using Atom for academic writing - Paquetes de Atom para la escritura académica.
• WriteMonkey - Una aplicación zenware para escribir sin distracciones.
• Doom Emacs - Una configuración para domar al imponente Emacs.
• LibreOffice - Un reemplazo libre y gratuito de la suite Office.
• RStudio - Entorno de desarrollo integrado para el lenguaje de programación R. Aunque generalmente se usa para ciencia de datos y estadística, también tiene otras cosas como R Markdown, Bookdown, RQDA y otros complementos interesantes.
• Marktext - Un editor Markdown simple y elegante, centrado en la velocidad y la usabilidad.
• Zettlr - Editor Markdown basado en el sistema Zettelkasten, pensado para académicos y con integración para gestores de referencias.

Software para la gestión de conocimiento personal

• Ver también software para notas y editores de texto
• Artificial Brain Networked notebook app - Una lista comparativa, colectiva, comentada y con ejemplos de software para la creación de un segundo cerebro.
• Trilium - Notas jerarquicas, sincronización con servidor propio, visualización de grafo, web-clipper y FOSS.
• Foam - Una versión libre de Roam con Visual Studio Code.
• Obsidian - Base de conocimiento personal sobre achivos Markdown con visualización de grafo, plugins, backlincks y algunas opciones de pago.
• TiddlyWiki - Un cuaderno digital no-lineal para capturar y organizar información compleja.
  • TiddlyMap - Un plugin para visualizar la información de tu wiki.
  • TiddlyResearch - Un ambiente de notas basado en TiddlyWiki.
• Nodebook - Create beautiful graphs with all your papers, files, notes and links, and always have an easy overview of your own thoughts and ideas.
• MindForger is human mind inspired personal knowledge management tool.
• Awesome Knowledge Management - Una lista seleccionada de artículos, personas, aplicaciones, bibliotecas de software y proyectos relacionados con la gestión del conocimiento. ^be20dd

Markdown

• Markdown Tutorial - Un tutorial interactivo para aprender Markdown en pocos minutos.
• Getting Started with Markdown - Una lección de Sarah Simpkin sobre Markdown académico.
• Markdown Cheatsheet - Hoja para recordar la sitaxis.
• Awesome Markdown - Una lista seleccionada sobre Markdown.
• Markdown for Scientific Publications

Pandoc

• Pandoc - La navaja suiza para la conversión de documentos creada por el filósofo John MacFarlane.
• Pandoc Starter - Un repositorio con varios archivos para comenzar con Pandoc.
• minimal make - Un mínimo tutorial sobre los makefiles para automatizar los procesos de Pandoc y utilizar plantillas LaTeX.
• Academic Pandoc Template - Una sencilla plantilla académica para artículos académicos.
• Pandoc Scholar - Plantilla académica completa con metadatos mejorados.
• Arabica - Plantilla para libros académicos con Pandoc y LaTeX.
• Plantillas pandoc aportadas por usuarios.
• Eisvogel - Una plantilla académica sencilla de pandoc LaTeX.

Escritura académica con Markdown + Pandoc

• Sustainable Authorship in Plain Text using Pandoc and Markdown - Un tutorial con lo que tienes que saber sobre la escritura en texto plano con Markdown y Pandoc.
• Escritura científica con Markdown - Una guía de Jaan Tollander de Balsch.
• Markdown and Pandoc for academic writing - Una pequeña introducción a las ventajas de Markdown y Pandoc en el trabajo académico. Incluye una plantilla YAML.
• The YAML Fieldguide - Una útil guía sobre YAML para tus documentos.
• A Plain Text Workflow for Academic Writing with Atom - Un flujo de trabajo que puede ayudarte a hacer el tuyo.
• Citando en texto plano - Tuturial de Juan Carlos Castillo.
• Acerca de escribir y publicar un libro con Bookdown, GitHub y Zotero por Jack Dougherty y compañía.
• scientific-markdown - Example for use of Markdown for scientific publications using Pandoc and latexmk.
• Template for writing a PhD thesis in Markdown - Clean organization of files to provide a framework for writing a PhD thesis in mostly Markdown with a little bit of LaTeX, and compiled with Pandoc.
• thesisdown - Un proyecto inspirado en bookdown para hacer tu tesis con R Markdown. Incluye plantillas de distintas Universidades.

Ilustración y visualización

• Inkscape Programa de vectores gráficos para diseño y arte digital.
• Mermaid - Sencilla herramienta de código para diagramar y graficar por medio de texto.
  • Mermaid Live Editor - Define simple diagrams instead of drawing them.
• diagrams.net - Open source, online, desktop and container deployable diagramming software.
• graphviz - Visualization software for graphs and networks which uses a domain-specific DOT language.
• PlantUML - Define UML diagrams instead of drawing them.

Git y GitHub

• Git and GitHub for Poets - Una serie de videos introductorios para no-programadores.
• Running a collaborative blog: A glossary for GitHub & Jekyll - Un glosario de términos frecuentes en GitHub y Jekyll.

Recursos

• The Plain Person’s Guide to Plain Text Social Science - Pequeña guía de Kieran Healy sobre el flujo de trabajo académico en texto plano para ciencias sociales. Contenido sobre R Markdown, editores de texto y hasta una una introducción a Emacs.
• The Programming Historian - Revista de historia y humanidades digitales con lecciones como:
  • Preserving Your Research Data - Para mantener consultables tus datos en el tiempo.
  • Fetching and Parsing Data from the Web with OpenRefine - Para explorar, limpiar y transformar datos de la Web.
  • Running a Collaborative Research Website and Blog with Jekyll and GitHub - Para construir tu página colaborativa de investigación.
• Investigación Social Abierta: Herramientas para la reproducibilidad, colaboración y comunicación académica_ Libro digital de Juan Carlos Castillo.
• Awesome Academic Writing “Una lista seleccionada de cosas increibles relacionadas con la escritura académica”.
  • Ten simple rules for scientists: Improving your writing productivity.
  • Writing for an academic journal: 10 tips.
  • How to write a scientific abstract in six easy steps.
  • Harvard Writing Resources.
  • Digital Humanities Literacy Guidebook - Overview on the field of Digital History and Digital Humanities.

Videos

• Los videos de Nicholas Cifuentes-Goodbody sobre Markdown, Pandoc o sobre Zotero, Bib(La)TeX, entre otros.
• Algunos flujos de trabajo con Zotero y otras herramientas como el de explauramay o el de Robert Karl para historiadores.
• Un ambiente de escritura académica con VSCodium
• How to create a bookdown book in 5 minutes.
• Brian Jenks sobre OrcID, Zotero, Mendeley y más.

Awesome awesome lists

• Scientific Writing - Para la escritura académica.
• Research Tools - Herramientas para la investigación.
• Citizen Science - Para hacer ciencia sin instituciones.
• Tools for Activism - Herramientas digitales para el activismo.
• Diversity - Creating a more inclusive and diverse tech community.
• Free Software - Free as in freedom.
• Data Visualization - Para la visualización de datos.
• Humane Technology - Open source projects that help improve society.
• Digital History - Computer-aided scientific investigation of history.